Баптистская церковь Хаапсалу возникла в 19-м столетии в результате религиозного пробуждения. Эстонские братья спросили Адама Рейнхолда Шиве, старшего из Немецкой Баптистской Церкви Санкт-Петербурга, помочь организовывать общину. 24-го февраля 1884 основали общину и Шиве крестил первых членов. Исторически, Баптистская Церковь Хаапсалу - первая баптистская церковь в Эстонии. Местными лидерами новой общины стали Юрий Зейзиг и Август Йоханнсон. До 1894 община оставалась отделением Петербургской церкви.
Церковь получила свой молитвенный дом в 1886 и расширила его в 1909. Большая реконструкция была осуществлена в 1929 (см фото).
Церковь служит Господу и людям различными способами: проповедь евангелия, молитвенные собрания, воскресная школа, музыкальное служение, группа по изучению Библии, социальная работа и т.д. (См. Фото)
Баптистская Церковь Хаапсалу имеет хорошие контакты с другими церквями города.
